A hipotalamusz az agyunk fontos területe, amely koordinálja a test alapvető szempontjait, például az érzelmeket, a testhőmérsékletet, a záróizmok egy részét, az éhséget, a szomjúságot. A hipotalamusz fő feladata a test azon tulajdonságainak szabályozása, amelyeket nem akarata vezérel, éppen ellenkezőleg, azokat, amelyeket természetünk, logikánk vagy ösztönünk által érzünk. Például, ha az ember nem iszik vizet, a test kiszárad, a hipotalamusz szomjúságjeleket küld, hogy figyelmeztesse, hogy a test egészségének megőrzése érdekében folyadékot kell bevenni.
A hipotalamusz a thalamus alatt helyezkedik el, a Diencephalon kis részét képezi, és az őt kísérő többi részével együtt az agy hormonjainak szekretált központjaként alkotja. A Hypothalamus jelentősége arra a módra esik, ahogyan a test (nem motorikus), de alapvető testfunkcióinak irányítását kezeli. Az érzelmek az egyik legérdekesebb feladatai a hipotalamusz, hiszen kapcsolódik a agy szár, azt sugározza érzések és érzelmi gesztusok szegregációját peptidek és aminosavak, amelyek a nucleus formájában neurohormonokra amelyek az emberi test érzést Szerelem, szomorúság, harag, félénkség, eufória, boldogság, a nyugalom és az összes többi.
A Hypothalamus szintén figyelemre méltó szerepet játszik, beszélünk a Hypophysis vagy az agyalapi mirigy szoros kapcsolatáról, amely negatív módon választja ki a hormonokat, de a Hypothalamusszal közösen, hogy a test stabil maradjon, a hypophysis kiválasztja azokat a hormonokat, amelyek elősegítik a teremtést valamint a test izom- és csontszöveteinek fejlődése, valamint segítséget nyújt az emberi serdülőkor fejlődéséhez. A hipotalamusz és az agyalapi mirigy közötti kapcsolat egyértelmű példája, hogy a prolaktin szekrécióját negatívan szabályozza a dopamin, egy neurotranszmitter. Vagyis, ha egy nő nem terhes, akkor nem kell kiválasztania a prolaktint, amely felelős az újszülött táplálásához szükséges anyatej előállításához, ezért a dopamin az agyalapi mirigyből választódik ki annak szabályozására, miközben nincs terhességi állapotban.