A vallási intolerancia kifejezés a vallási meggyőződésekkel vagy gyakorlatokkal szembeni intolerancia egy formáját, vagy ennek hiányában az ilyen szokások hiányát jelenti, amelyet egy személy vagy egy csoport birtokol. Ezt számos tényező okozhatja, többek között megemlíthetik a különböző vallási meggyőződés tényét, eltérő ideológiát, valamint a vallásellenes hangulat egyszerű tényét. Ez a fajta hozzáállás akár agresszióhoz is vezethetfizikai, verbális, pszichológiai, többek között. Világos példa a vallásüldözés ilyen típusú intoleranciájára, amelyet manapság a világ különböző területein tapasztalnak. A társadalom ilyen típusú attitűdjeinek fő oka elsősorban a vallási tolerancia, a vallásszabadság és a pluralizmus hiánya, ami a vallást illeti.
Fontos megjegyezni, hogy egyetlen oka nem magyarázza a vallási intoleranciát, ugyanakkor nagyon általános érvről beszélhetünk azok között, akik az egyik vallást gyakorolják, és másokkal szemben intoleránsak. Ez az érvelés nagyon egyszerű: általában mindenki vallását tartja igaznak, emiatt normális, ha az ő szemszögükből ellentmondanak a hamis tanokat védőknek.
Ez olyan régi jelenség, mint a vallás megfelelő eredete. Az ókorban, amikor az első keresztények végrehajtották szertartásaikat, a katakombákba kellett bújniuk, mivel a korabeli római hatóságok nem tűrték el az ilyen hiteket. Az ókortól kezdve a zsidó nép történelmének számos pillanatában üldöztetés áldozata lett, és ennek az üldözésnek a legfőbb motivációja éppen az ellenségeskedés volt az általuk fenntartott szokásokkal és hiedelmekkel szemben.
Másrészt a kolumbusz előtti népek vallási elképzeléseivel a keresztények harcoltak, amikor megérkeztek az amerikai kontinensre. Még a kereszténységen belül is előfordult intolerancia más keresztény tanokkal szemben, amelyeket eretnekségnek vagy hiteles hittől való eltérésnek minősítettek. Mindezek az említett esetek annak a jele, hogy a mások meggyőződésének elutasítása és intoleranciája állandó volt, ami ősidők óta bekövetkezik és a mai napig tart.